Дженсен появился на свет в Далласе, штат Техас в 1-й день весны в 1978 г. Мальчика назвали в честь 1-го из авторов церковного гимна. Семья актёра хоть и посещала довольно часто церковь, но к фанатам религии Дженсон себя не относит. Алан Роджер Эклс, отец Дженсена, был для мальчика кумиром. Уже в четыре года ребёнок точно знал чего хочет и даже принял участие в съёмках рекламных роликов. Алан поддерживал увлечения сына, но и о его здоровье не забывал, так что, посещение курсов актёрского мастерства, Дженсен совмещал с занятиями спортом.
В более зрелом возрасте, когда перед парнем встал выбор куда поступить учиться, он захотел стать физиотерапевтом, но, поступившее предложение принять участие в съёмках фильма, круто изменило все благочестивые планы юноши. В 1996 году, он собрал вещички и отправился в Лос-Анджелес. Нельзя сказать что звёздная карьера складывалась у начинающего актёра очень удачно, но фильмы и сериалы с участием Дженсена Эклса появлялись с завидной регулярностью. Эпизодические, второстепенные роли в сериалах, роль Эрика Брэйди в телесериале «Дни нашей жизни», добавляли ему опыта, поклонников и поклонниц. Начиная с 2000 года, он уже начал работать в нескольких проектах сразу. Не успел закончиться сериал «Тёмный ангел» (2000 — 2002 гг.), как поступило предложение сняться в мини-сериале «Блондинка» (2001 г.), и практически сразу появился сериал «Тайны Смолвиля» (2001 — 2011) с участием Дженсена в роли Джейсона Тигса в 4-м сезоне на постоянной основе.
В 2005 году, актёру посчастливилось сняться с отцом в фильме «Пожиратель душ», где Дженсен сыграл Джейка Грея — парня который страдает от возникающих перед глазами видений жестоких убийств. В этом же году, Дженсена пригласили и в сериал ставший для актёра не только сценической площадкой, но и открытой дверью для новых возможностей. Именно здесь, он попробовал себя в режиссёрском качестве. Четвёртая серия в 6-м сезоне снята Дженсеном от начала и до конца. Также он снял самостоятельно каждую третью серию в 7-м, 8-м и 10-м сезонах.
Кроме долгоиграющего сериала вышло ещё 2 фильма с участием Эклса — это «Десятидюймовый герой» и фильм ужасов «Мой кровавый Валентин». Личная жизнь у звёздного красавчика на данный момент устоялась. Он уже довольно продолжительное время женат на гимнастке Дэннил Харрис, и счастлив воспитывая троих ребятишек - дочь, которую назвали Джастин Джей и близнецов мальчика Зеппелина Брэма и девочку Эрроу Родс. Супруга после замужества, взяла фамилию актёра.